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Jul 23, 2023

Relógio transcriptômico prediz alterações vasculares da retinopatia diabética prodrômica

Scientific Reports volume 13, Artigo número: 12968 (2023) Citar este artigo

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A retinopatia diabética é uma complicação comum do diabetes de longa duração e pode levar à perda de visão. Infelizmente, a retinopatia diabética precoce permanece pouco compreendida. Não existe uma forma eficaz de prevenir ou tratar a retinopatia diabética precoce até que os pacientes desenvolvam fases posteriores da retinopatia diabética. A densidade capilar acelular elevada é considerada uma característica quantitativa confiável presente no desenvolvimento inicial da retinopatia. Assim, neste estudo, interrogamos todas as alterações transcriptômicas vasculares da retina através de um modelo de rato do Nilo para entender melhor a patogênese inicial da retinopatia diabética. Descobrimos a complexidade das associações entre a densidade capilar acelular e os fatores conjuntos de glicemia, dieta e sexo, que foi modelada através de uma rede Bayesiana. Usando regressões segmentadas, identificamos diferentes padrões de expressão gênica e termos enriquecidos de Gene Ontology (GO) associados ao aumento da densidade capilar acelular. Desenvolvemos um modelo de regressão florestal aleatória baseado em padrões de expressão de 14 genes para prever a densidade capilar acelular. Como a densidade capilar acelular é uma característica quantitativa confiável na retinopatia diabética precoce, nosso modelo pode ser usado como um relógio transcriptômico para medir a gravidade da progressão da retinopatia precoce. Também identificamos NVP-TAE684, geldanamicina e NVP-AUY922 como os três principais medicamentos potenciais que podem potencialmente atenuar a RD precoce. Embora precisemos de mais estudos in vivo no futuro para apoiar os nossos medicamentos reaproveitados, fornecemos uma abordagem baseada em dados para a descoberta de medicamentos.

A retinopatia diabética é uma complicação comum do diabetes de longa duração que resulta em danos aos vasos sanguíneos da retina e pode progredir para a perda de visão. Em vários países desenvolvidos, incluindo os Estados Unidos, a retinopatia diabética é a principal causa de novos casos de cegueira entre adultos com idades compreendidas entre os 20 e os 741 anos. As pessoas que vivem com diabetes, independentemente dos subtipos clínicos, têm cerca de um terço de probabilidade de desenvolver retinopatia diabética2. , afetando de forma semelhante tanto homens quanto mulheres em geral3,4.

Nos estágios iniciais, a retinopatia diabética (RD) não proliferativa pode ser detectada por triagem quando a visão ainda não está afetada. No entanto, não existe uma forma eficaz de retardar ou parar a progressão da doença para prevenir a perda de visão, onde os pacientes são frequentemente deixados sem tratamento até fases posteriores. Além disso, a retinopatia diabética não é reversível e continuará a progredir. Eventualmente, alguns casos evoluirão para retinopatia diabética proliferativa, onde a fibrose se desenvolve na superfície da retina e novos vasos anormais propensos a hemorragias levam à perda de visão5. Para prevenir a perda de visão causada pela retinopatia diabética, precisamos compreender a patogênese precoce da retinopatia assintomática. Infelizmente, estes processos iniciais permanecem pouco compreendidos, em parte devido ao material histológico insuficiente de dadores humanos e aos modelos animais limitados que podem recapitular a progressão natural da retinopatia diabética humana6.

O rato do Nilo (Arvicanthis niloticus), nativo do Norte de África, é um roedor diurno com uma dieta geral de caules de gramíneas7. No entanto, quando alimentado com ração convencional para roedores em ambiente de laboratório, o rato do Nilo desenvolve rapidamente diabetes induzido pela dieta em ambos os sexos. Para esclarecer, a ração convencional para roedores, embora destinada a sustentar roedores de laboratório comuns saudáveis, é hipercalórica, em relação à dieta nativa, para as espécies de ratos do Nilo e será posteriormente descrita como uma dieta altamente calórica. Para prevenir o diabetes induzido por dieta em ambiente de laboratório, o rato do Nilo pode ser alimentado com uma dieta rica em fibras8. Assim, o diabetes induzido por dieta no rato do Nilo parece seguir a progressão natural do diabetes tipo 2 em humanos. Nosso estudo anterior demonstrou que ratos diabéticos do Nilo poderiam desenvolver retinopatia com lesões retinianas avançadas semelhantes às características clínicas ligadas à perda de visão em humanos, como edema macular, não perfusão capilar e retinopatia diabética proliferativa9. Especificamente, as lesões em ratos do Nilo incluíram vazamento de retina, espessamento da retina, não perfusão capilar, anormalidades microvasculares intrarretinianas e retinopatia diabética proliferativa aparente, com base na neovascularização observada além da superfície da retina9. Normalmente, outros modelos de roedores com retinopatia diabética induzida por dieta não apresentam o dano microvascular exato observado em humanos e muitas vezes carecem de neovascularização proliferativa. No entanto, a neovascularização foi observada em ratos do Nilo relativamente mais velhos e a idade pode desempenhar um papel na neovascularização. Nesse estudo, também demonstramos que a densidade capilar acelular elevada é uma característica quantitativa confiável presente no desenvolvimento inicial da retinopatia, precedendo disfunção vascular adicional em pericitos e células endoteliais9. O uso da densidade capilar acelular da retina como um dos primeiros marcadores de retinopatia é consistente tanto em ratos do Nilo9 quanto em humanos10. Portanto, raciocinamos que a alteração da vasculatura retiniana é um importante fator causal no início e na condução da patogênese da retinopatia diabética. Como a densidade capilar acelular da retina é uma das alterações detectáveis ​​iniciais relevantes para a disfunção vascular da retina, poderíamos usar a densidade capilar acelular para marcar a progressão precoce da doença na retinopatia diabética.

 100 mg/dL9. Hence, we could investigate if diet could affect acellular capillary density independent of RBG. Additionally, since retinopathy can have differences between males and females, we also included sex in our acellular capillary density analysis. To understand individual factors contributing to increased acellular capillary density, we developed a Bayesian network (BN) to calculate the conditional probability of high acellular capillary density based on RBG, diet, and sex. As shown in Fig. 2C, the likelihood of a high acellular capillary density is progressively increased when factors of blood glucose level, diet, and sex are combined. For example, a Nile rat on a high-caloric diet will have a 43.07% chance of developing acellular capillary density greater than 10 counts per mm2. This probability increases to 62.0% if this Nile rat also has an RBG > 100 mg/dL. Furthermore, if this Nile rat is male, the possibility will further increase to 80.56%. Hence, a male Nile rat on a high-caloric diet with a high blood glucose level will have a much higher chance of presenting high acellular capillary density, a quantitative marker for early retinopathy./p> 10 counts per mm2) suggests that combined factors of high RBG, high-caloric diet, and the male will result in a twofold increase the likelihood of high ACD than any factors alone./p> 0.4; Fig. 5). Absolute Rho values greater than 0.4 are generally considered to have correlated patterns31. We then searched LINCS L1000 chemical compound perturbated gene expression database32 to find drugs that could potentially reverse this pattern (i.e., a compound that can down-regulate the gene expression for acellular capillary density positively correlated genes while up-regulating the gene expression for acellular capillary density negatively correlated genes). We found NVP-TAE684, geldanamycin, and NVP-AUY922 to be the top three compounds identified to potentially reverse the retinal vascular phenotype associated with high acellular capillary density (Fig. 5). NVP-TAE684 is an anaplastic lymphoma kinase (ALK) inhibitor. ALK is a receptor tyrosine kinase belonging to the insulin receptor superfamily sharing a high degree of homology with leukocyte tyrosine kinase (LTK)33. Both geldanamycin and NVP-AUY922 are Hsp90 inhibitors11,12. Interestingly, studies have shown that a short-time treatment of Hsp90 inhibitor can stimulate a retina stress response with molecular chaperone expression, preventing retinal degeneration in models of retinitis pigmentosa and age-related macular degeneration13. Although no study shows that Hsp90 inhibitors can be used to treat early retinopathy, there is evidence that Hsp90 inhibitors, such as AUY922, can protect and repair microvascular endothelial cells related to endothelial barrier dysfunction in a different biological context (e.g., human lung34). Retina endothelial dysfunction is a significant complication that drives diabetic retinopathy35,36. Hence, it is likely that Hsp90 inhibitors (geldanamycin and NVP-AUY922) can potentially treat or protect early retinopathy via modulating microvascular endothelial cells./p> 0.4 between gene expression values and acellular capillaries density (ACD). Searching LINCS L1000 chemical compound perturbated gene expression database identified NVP-TAE684, geldanamycin, and NVP-AUY922 as the top three candidates./p>

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